[Todos CMAT] Seminario del Instituto de Estadística

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Vie Oct 11 09:40:27 -03 2019


Seminario del Instituto de Estadística
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Título: "Un test de hipótesis sobre ancestría"

Expositor: Gabriel Illanes (CMAT-FCIEN-UdelaR)

Resumen:
 
Desde la completación del proyecto "Human Genome Project" en 2003, se ha
utilizado la información genética de los individuos para resonder distintas
preguntas. Una base de datos muy usada es la del "1000 genomes project"; uno de
los usos es es el estudio de las migraciones de distintas poblaciones
ancestrales.  En nuestro caso, contamos con la base de datos del proyecto
"Urugenomes", disponiendo de la información genética de 20 individuos uruguayos;
10 de ellos declaran tener algún ancestro nativo americano, 10 de ellos declaran
tener algún ancestro africano. Dado el tamaño de la base de datos, nos enfocamos
en intentar responder preguntas a nivel individual, y no a nivel poblacional.
Para cada uno de estos individuos, asumimos que es una mezcla de tres
poblaciones ancestrales (europeos, africanos, y nativos americanos), y
utilizamos algoritmos que permiten la identificación de los intervalos de su
genoma que corresponden a cada una de esas poblaciones ancestrales. Con esta
información, queremos desarrollar un test de hipótesis que permita saber si es
posible que un individuo dado tenga un ancestro nativo americano puro "T"
generaciones atrás.

Recuerden que todas las presentaciones y el programa tentativo   de las próximas
charlas está disponible en   https://github.com/natydasilva/SIESTA
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Martes 15/10 a las 14:00, Instituto de Estadística (Eduardo Acevedo 1139)

Contacto: Natalia Da Silva (IESTA) - natydasilva en iesta.edu.uy
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Más seminarios en: http://www.cmat.edu.uy/seminarios
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