[Probabilidad-Estadistica-Seminario] Invitación defensa - Gerardo Martínez

[Gerardo Martínez]

Buenos días:

Es un placer invitarles a la defensa de Maestría en Ingeniería 
Matemática de Gerardo Martínez, que tendrá lugar este viernes 13 a las 
13:00, por zoom.

El link para la defensa es el siguiente:
https://salavirtual-udelar.zoom.us/j/83749033004

Título: *Análisis de componentes principales para datos genómicos en 
presencia de datos faltantes *
Directores de tesis: Dra. María Inés Fariello, Dr. Ignacio Ramírez

Tribunal:
Dr. Mathias Bourel (IMERL – FING).
Dr. Marcelo Fiori (IMERL - FING).
Dra. Lucía Spangenberg (Institut Pasteur de Montevideo)

Resumen:
/La asignación de individuos a poblaciones es frecuentemente realizada 
en términos socioculturales y geográficos. El estudio de la estructura 
poblacional en términos genéticos implica estudiar si esta asignación es 
consistente con la diversidad genética de los individuos de estudio. En 
este contexto es que aparece el análisis de componentes principales 
(PCA) como herramienta fundamental. La proyección de datos genómicos 
sobre las primeras componentes principales permite revelar las 
relaciones que puedan existir entre individuos en términos de su 
composición genética. Por diversas razones, como es el caso en que se 
estudia ADN ancestral o en el estudio de poblaciones con mezcla, la base 
de datos de la que se parte para hacer un PCA puede contener entradas 
desconocidas. Un tratamiento naíf de los datos faltantes puede llevar a 
conclusiones erróneas sobre las relaciones entre los individuos 
estudiados. Por esta razón, es relevante el estudio de técnicas que 
permitan realizar un PCA en el contexto de datos faltantes. En este 
trabajo estudiamos y comparamos algunas de estas técnicas con el 
objetivo de aplicarlas para entender la estructura de poblaciones. 
Estaremos interesados en técnicas que recuperen la estructura de 
poblaciones homogéneas y mezcladas de forma satisfactoria (es decir, 
cercana a la que obtendríamos sin datos faltantes) pero también nos 
interesará el problema de la escalabilidad y la velocidad de los 
algoritmos. /

Saludos,
Gerardo Martínez

------------ próxima parte ------------
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