[Probabilidad-Estadistica-Seminario] Seminario de Probabilidad y Estadística -- Viernes 6 de octubre

[Andrés Sosa]

Hola

Este* viernes 6 de octubre a las 10:30 horas *en el salón de seminarios del
Centro de Matemática hablará *Flavio Pazos* (Instituto de Investigaciones
Biológicas Clemente Estable) en el seminario de Probabilidad y Estadística.

El título de la charla es: *Cluster Locator, una herramienta en línea para
el análisis y la visualización del agrupamiento de genes en cinco
organismos modelo. *

Flavio Pazos Obregón*1,2, Pablo Soto1, José Luis Lavín3, Ana Rosa
Cortázar3, Rosa Barrio4, Ana María Aransay3,5, Rafael Cantera1,6

1: Departamento de Biología del Neurodesarrollo, IIBCE, Motevideo, Uruguay.
2: Instituto de Matemática y Estadística “Rafael Laguarda”, Facultad de
Ingeniería, UDELAR, Uruguay. 3: Plataforma de Análisis del Genoma, CIC
bioGUNE, Derio, España. 4: Unidad de Genómica Funcional,  CIC bioGUNE,
Derio, España. 5: CIBERehd, ISCIII, Madrid, España.  6: Departamento de
Zoología, Universidad de Estocolmo, Suecia. * fpazos en iibce.edu.uy

Saludos.
Andrés




*Resumen:En organismos eucariotas, los grupos de genes que comparten
función no están distribuidos de manera aleatoria en el genoma. En nuestro
laboratorio investigamos la posibilidad de entrenar algoritmos de
aprendizaje automático para predecir nuevas funciones de genes a partir de
sus ubicaciones relativas en el genoma. En esa línea, hemos comenzado a
desarrollar herramientas de análisis que permitan estudiar sistemáticamente
los patrones de distribución de listas de genes. Hemos implementado
“Cluster Locator”, una herramienta en línea (disponible en
http://clusterlocator.bnd.edu.uy/ <http://clusterlocator.bnd.edu.uy/>) que
permite caracterizar la manera en que los genes de una lista proporcionada
por el usuario están distribuidos a lo largo del genoma al que pertenecen,
calculando además la significancia estadística de esa distribución.  Con
esa herramienta ya hemos caracterizado la distribución de cientos de grupos
funcionales en cinco organismos modelo; Homo sapiens, Mus musculus,
Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans y Saccharomyces cerevisiae.
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